Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms