Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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