Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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