Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK7Q16549 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms