Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CNGA3Q16281 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CNGA3Q16281 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms