Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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