Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PDCD1Q15116 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PDCD1Q15116 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PDCD1Q15116 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PDCD1Q15116 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PDCD1Q15116 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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