Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms