Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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