Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms