Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms