Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms