Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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TUBB3Q13509 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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