Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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