Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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