Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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