Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CDH17Q12864 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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