Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC173Q0VFZ6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms