Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms