Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms