Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms