Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms