Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms