Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA5Q01523 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA5Q01523 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms