Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms