Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRX1P78414 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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