Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA4P51532 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms