Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTGIRP43119 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms