Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms