Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms