Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms