Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TGFBR1P36897 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms