Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms