Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms