Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms