Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms