Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PTPREP23469 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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