Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGS1P23219 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms