Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRAFP15056 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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