Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms