Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms