Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODC1P11926 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms