Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRATO95237 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRATO95237 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms