Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms