Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSTPIP1O43586 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms