Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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