Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBAG9O00559 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms