Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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