Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF26H0Y7S4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms