Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms